Nøyaktig hvorfor noen får flass, vet man ikke, men sannsynligvis er årsaken til flass en liten gjærsopp (Malassezia furfur) som vanligvis finnes på huden hos de fleste voksne. Soppen kan finnes hos barn, men det er først i puberteten at den fører til flass, da fettutskillingen øker, noe som gjør at balansen i hårbunnen endres og soppen kan vokse.

Når hårbunnen irriteres av soppen, begynner den å overprodusere hudceller. Når de dør og pakkes sammen i det øverste hudlaget, dannes det hvite flak som faller av. Personer med unormal produksjon av hudceller og dermed stor utskilling av flass, har enten uvanlig mye av denne soppen i hårbunnen, eller er ekstra følsom for den.